Industri tahu menghasilkan limbah cair dan padat. Satu industri tahu rumahan dapat menghasilkan 20 m3 /hari limbah cair. Akibat dari pembuangan limbah cair yang dihasilkan dari industri tahu tanpa pengolahan terlebih dahulu mengakibatkan terjadinya pencemaran lingkungan perairan, maka perlu adanya alternatif pengolahan salah satunya menggunakan proses bioremediasi. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh variasi volume bioaktivator dan waktu tinggal terhadap kadar COD, pH dan TSS limbah cair tahu di Kota Samarinda pada proses bioremediasi secara anaerob-aerob. Penelitian ini menggunakan prinsip reaktor secara anaerob-aerob dengan mencampurkan l i m b a h c a i r tahu dan larutan bioaktivator mol bonggol pisang ke dalam reaktor. Variasi perlakuan pada penelitian ini menggunakan larutan bioaktivator mol dari bonggol pisang dengan variasi volume 30 ml, 60 ml, 90 ml dan 120 ml. Dan variasi waktu tinggal 2, 4 dan 6 hari dengan parameter yang diukur yaitu COD, pH dan TSS. Hasil terbaik diperoleh pada waktu tinggal 6 hari dengan penambahan bioaktivator mol bonggol pisang 120 ml diperoleh kadar COD sebesar 6050 mg/L, pH sebesar 8,16 dan TSS sebesar 290 mg/L. Berdasakan Peraturan Daerah Provinsi Kalimantan Timur No.2 tahun 2011, nilai pH yang sudah memenuhi baku mutu lingkungan sedangkan kadar COD dan TSS belum memenuhi standar baku mutu lingkungan.